Análisis de asociación entre polimorfismos (rs941798 y rs914458) del gen PTPN1 y diabetes tipo 2 en familias de Lima-Perú

Autores/as

DOI:

https://doi.org/10.24265/horizmed.2019.v19n4.03

Palabras clave:

Diabetes mellitus tipo 2, Proteína tirosina fosfatasa no receptora tipo 1, Marcadores genéticos, Polimorfismo de nucleótido simple

Resumen

Objetivo: Analizar la asociación de los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) rs941798 y rs914458 del gen PTPN1 con la diabetes tipo 2 en familias peruanas de Lima. Materiales y métodos: Veintitrés tríos familiares fueron captados en el Hospital Nacional Arzobispo Loayza. Se extrajeron muestras de sangre periférica para obtener el ADN y luego las frecuencias alélicas y genotípicas de los SNP. La genotipificación de los SNP se realizó mediante secuenciación. El análisis de asociación basado en familias entre los SNP y la diabetes tipo 2 se realizó con el programa FBAT. Resultados: Se observaron los 3 genotipos posibles para cada SNP, rs941798 (A>G) y rs914458 (G>C). Las pruebas de asociación basada en familias a nivel alélico mostraron al alelo A del SNP rs941798 asociado a la diabetes tipo 2 (p = 0.023) bajo uno de los modelos evaluados; no obstante, tras la corrección de Bonferroni para comparaciones múltiples, esta asociación se perdió. No se evidenció asociación entre los SNP y la enfermedad en ningún nivel (alélico, genotípico o haplotípico). Conclusiones: No se encontraron evidencias de asociación significativa entre los SNP rs941798 y rs914458 del gen PTPN1 con la DT2 en familias peruanas de Lima, en ninguno de los niveles estudiados (alélico, genotípico y haplotípico).

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Citas

International Diabetes Federation. IDF Diabetes Atlas. 8th edition. Brussels: International Diabetes Federation; 2017.

Ministerio de Salud del Perú. Análisis de las causas de mortalidad en el Perú, 1986-2015. 1ra edición. Lima: Ministerio de Salud del Perú; 2018. 226 p.

Villena JE. Epidemiología de la diabetes mellitus en el Perú. Diagnóstico. 2016; 55(4): 173-81.

Kwak SH, Park KS. Recent progress in genetic and epigenetic research on type 2 diabetes. Exp Mol Med. 2016; 48(3): e220.

Beagley J, Guariguata L, Weil C, Motala AA. Global estimates of undiagnosed diabetes in adults. Diabetes Res Clin Pract. 2014; 103(2): 150-60.

Kalyani RR, Saudek CD, Brancati FL, Selvin E. Association of diabetes, comorbidities, and A1C with functional disability in older adults: results from the National Health and Nutrition Examination Survey (NHANES), 1999–2006. Diabetes care. 2010; 33(5): 1055-60.

American Diabetes Association. Standards of medical care in diabetes-2016 abridged for primary care providers. Clin Diabetes. 2016; 34(1): 3-21.

Gurzov EN, Stanley WJ, Brodnicki TC, Thomas HE. Protein tyrosine phosphatases: molecular switches in metabolism and diabetes. Trends Endocrinol Metab. 2015; 26(1): 30-9.

Feldhammer M, Uetani N, Miranda-Saavedra D, Tremblay ML. PTP1B: a simple enzyme for a complex world. Crit Rev Biochem Mol Biol. 2013; 48(5): 430-45.

Sun J, Qu C, Wang Y, Huang H, Zhang M, Li H, et al. PTP1B, a potential target of type 2 Diabetes Mellitus. Mol Biol. 2016; 5(4): 174.

Tsou RC, Bence KK. The Genetics of PTPN1 and Obesity: insights from mouse models of tissue-specific PTP1B deficiency. J Obes. 2012; 2012: 1-8.

Di Paola R, Frittitta L, Miscio G, Bozzali M, Baratta R, Centra M, et al. A variation in 3′ UTR of hPTP1B increases specific gene expression and associates with insulin resistance. Am J Hum Genet. 2002; 70(3): 806-12.

Palmer ND, Bento JL, Mychaleckyj JC, Langefeld CD, Campbell JK, Norris JM, et al. Association of protein tyrosine phosphatase 1B gene polymorphisms with measures of glucose homeostasis in Hispanic Americans: the insulin resistance atherosclerosis study (IRAS) family study. Diabetes. 2004; 53(11): 3013-9.

Cheyssac C, Lecoeur C, Dechaume A, Bibi A, Charpentier G, Balkau B, et al. Analysis of common PTPN1 gene variants in type 2 diabetes, obesity and associated phenotypes in the French population. BMC Med Genet. 2006; 7(1): 44.

Bento JL, Palmer ND, Mychaleckyj JC, Lange LA, Langefeld CD, Rich SS, et al. Association of protein tyrosine phosphatase 1B gene polymorphisms with type 2 diabetes. Diabetes. 2004; 53(11): 3007-12.

Hawley M, Kidd KK. HAPLO: a program using the EM algorithm to estimate the frequencies of multi-site haplotypes. J Hered. 1995; 86(5): 409-11.

Rabinowitz D, Laird NM. A unified approach to adjusting association tests for population admixture with arbitrary pedigree structure and arbitrary missing marker information. Hum Hered. 2000; 50(4): 211-23.

Laird NM, Horvath S, Xu X. Implementing a unified approach to family-based tests of association. Genet Epidemiol. 2000; 19(Suppl.1): 36-42.

Horvath S, Xu X, Laird NM. The family based association test method: strategies for studying general genotype-phenotype associations. Eur J Hum Genet. 2001; 9(4): 301-6.

Prasad RB, Groop L. Genetics of type 2 diabetes-pitfalls and possibilities. Genes (Basel). 2015; 6(1): 87-123.

Vassy JL, Hivert MF, Porneala B, Dauriz M, Florez JC, Dupuis J, et al. Polygenic type 2 diabetes prediction at the limit of common variant detection. Diabetes. 2014; 63(6): 2172-82.

Florez JC, Agapakis CM, Burtt NP, Sun M, Almgren P, Råstam L, et al. Association testing of the protein tyrosine phosphatase 1B gene (PTPN1) with type 2 diabetes in 7,883 people. Diabetes. 2005; 54(6): 1884-91.

Paredes Anaya M, García-Quispes WA, Lizaraso Soto F, Padilla Rojas C, Torres-Gonzales D, Calderón Ticona J, et al. Análisis de asociación genética entre el SNP RS914458 del gen proteína tirosina fosfatasa no receptor tipo 1 (PTPN1) y diabetes tipo 2 en población peruana. Horiz Med. 2014; 14(4): 31-6.

Ghosh S, Watanabe RM, Hauser ER, Valle T, Magnuson VL, Erdos MR, et al. Type 2 diabetes: evidence for linkage on chromosome 20 in 716 finnish affected sib pairs. Proc Natl Acad Sci USA. 1999; 96(5): 2198–203.

Traurig M, Hanson RL, Kobes S, Bogardus C, Baier LJ. Protein tyrosine phosphatase 1B is not a major susceptibility gene for type 2 diabetes mellitus or obesity among Pima Indians. Diabetología. 2007; 50(5): 985–9.

Bodhini D, Radha V, Ghosh S, Majumder PP, Mohan V. Lack of association of PTPN1 gene polymorphisms with type 2 diabetes in South Indians. J Genet. 2011; 90(2): 323–6.

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Publicado

2019-11-30

Cómo citar

1.
Sanchez-Castro EE, La Torre-Ramírez R, Padilla Rojas CP, Lizaraso-Soto F, Calderón Ticona J, Solís Villanueva J, García-Quispes WA, Paredes Anaya MY. Análisis de asociación entre polimorfismos (rs941798 y rs914458) del gen PTPN1 y diabetes tipo 2 en familias de Lima-Perú. Horiz Med [Internet]. 30 de noviembre de 2019 [citado 16 de abril de 2024];19(4):14-9. Disponible en: https://www.horizontemedico.usmp.edu.pe/index.php/horizontemed/article/view/928

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