Análisis de asociación entre polimorfismos (rs941798 y rs914458) del gen PTPN1 y diabetes tipo 2 en familias de Lima-Perú

  • Enrique Eduardo Sanchez-Castro Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Laboratorio de Genética de Enfermedades Metabólicas. Lima, Perú http://orcid.org/0000-0002-2319-5192
  • Renato LaTorre-Ramírez Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Laboratorio de Genética de Enfermedades Metabólicas. Lima, Perú http://orcid.org/0000-0001-8900-2085
  • Carlos Patricio Padilla Rojas Instituto Nacional de Salud Perú. Laboratorio de Biotecnología y Biología Molecular. Lima, Perú http://orcid.org/0000-0002-0562-0431
  • Frank Lizaraso-Soto Universidad de San Martín de Porres (USMP). Facultad de Medicina. Lima, Perú http://orcid.org/0000-0001-9993-9998
  • Jorge Calderón Ticona Hospital Nacional Arzobispo Loayza. Servicio de Endocrinología. Lima, Perú
  • José Solís Villanueva, Dr. Hospital Nacional Arzobispo Loayza. Servicio de Endocrinología. Lima, Perú
  • Wilser Andrés García-Quispes Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Laboratorio de Genética de Enfermedades Metabólicas. Lima, Perú http://orcid.org/0000-0001-6628-2985
  • Mónica Yolanda Paredes Anaya Universidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Laboratorio de Genética de Enfermedades Metabólicas. Lima, Perú http://orcid.org/0000-0002-9038-2270

Resumen

Objetivo: Analizar la asociación de los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) rs941798 y rs914458 del gen PTPN1 con la diabetes tipo 2 en familias peruanas de Lima.


Materiales y métodos: Veintitrés tríos familiares fueron captados en el Hospital Nacional Arzobispo Loayza. Se extrajeron muestras de sangre periférica para obtener el ADN y luego las frecuencias alélicas y genotípicas de los SNP. La genotipificación de los SNP se realizó mediante secuenciación. El análisis de asociación basado en familias entre los SNP y la diabetes tipo 2 se realizó con el programa FBAT.


Resultados: Se observaron los 3 genotipos posibles para cada SNP, rs941798 (A>G) y rs914458 (G>C). Las pruebas de asociación basada en familias a nivel alélico mostraron al alelo A del SNP rs941798 asociado a la diabetes tipo 2 (p = 0.023) bajo uno de los modelos evaluados; no obstante, tras la corrección de Bonferroni para comparaciones múltiples, esta asociación se perdió. No se evidenció asociación entre los SNP y la enfermedad en ningún nivel (alélico, genotípico o haplotípico).


Conclusiones: No se encontraron evidencias de asociación significativa entre los SNP rs941798 y rs914458 del gen PTPN1 con la DT2 en familias peruanas de Lima, en ninguno de los niveles estudiados (alélico, genotípico y haplotípico).

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Publicado
2019-12-05
Cómo citar
SANCHEZ-CASTRO, Enrique Eduardo et al. Análisis de asociación entre polimorfismos (rs941798 y rs914458) del gen PTPN1 y diabetes tipo 2 en familias de Lima-Perú. Horizonte Médico (Lima), [S.l.], v. 19, n. 4, p. 14-19, dic. 2019. ISSN 2227-3530. Disponible en: <http://www.horizontemedico.usmp.edu.pe/index.php/horizontemed/article/view/928>. Fecha de acceso: 05 abr. 2020 doi: https://doi.org/10.24265/horizmed.2019.v19n4.03.
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